“07年第四季度，我們實驗室的整體工作效率提高了30%以上，物信息科研任務(wù)已取得階段性成果，感謝所有同事的辛勤工作，也感謝校方給予我們的鼎力支持。”在南方醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院腫瘤研究所下屬的醫(yī)學(xué)信息檢測技術(shù)重點實驗室年底工作總結(jié)會議上，實驗室負責(zé)人慷慨陳詞，說出了每個科研人員的心聲。
南方醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)信息檢測技術(shù)重點實驗室長期致力于生物信息技術(shù)的分析和科研工作，承擔(dān)過多項國家、學(xué)校的學(xué)術(shù)研究，曾經(jīng)成功發(fā)現(xiàn)SARS病毒致命的主要物質(zhì)成分，為治療SARS藥物的問世提供了可能。
在承擔(dān)大量的信息數(shù)據(jù)處理工作的過程中，院系師生發(fā)現(xiàn)，整個IT系統(tǒng)的運算性能、網(wǎng)絡(luò)速度、流量等壓力陡增，工作效率明顯降低?，F(xiàn)代生物科學(xué)研究對大規(guī)?？茖W(xué)計算有很深的依賴性，平臺性能對于科研進度及質(zhì)量影響很大。而醫(yī)學(xué)信息檢測技術(shù)重點實驗室正在使用的服務(wù)器是多年前部署的老機型，已經(jīng)不能適應(yīng)現(xiàn)代生物信息研究對龐雜數(shù)據(jù)處理能力的需要，尤其是運算性能、網(wǎng)絡(luò)速度的降低，已經(jīng)成為實驗室提高科研能力的巨大瓶頸。
醫(yī)學(xué)信息檢測技術(shù)重點實驗室向來被視為南方醫(yī)科大學(xué)乃至整個華南地區(qū)重要的生物科學(xué)研究資源，在其發(fā)展過程中得到學(xué)校領(lǐng)導(dǎo)的高度關(guān)注。在了解到這一情況后，學(xué)校馬上成立專門部門，研究實驗室IT基礎(chǔ)設(shè)施優(yōu)化的解決方案。經(jīng)過近2個月的嚴(yán)密考察與周詳論證，南方醫(yī)科大學(xué)最終決定采購浪潮天梭TS10000高性能服務(wù)器，解決該實驗室IT系統(tǒng)優(yōu)化問題。
這是廣東省首次采用四核計算處理平臺構(gòu)建的TS10000高性能科學(xué)計算系統(tǒng)并得到成功應(yīng)用。
此后，浪潮與南方醫(yī)科大信息檢測技術(shù)重點實驗室通力配合，準(zhǔn)確分析并把握了實驗室網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用現(xiàn)狀和需求特點，專門設(shè)計了高性能、低成本的服務(wù)器平臺浪潮天梭TS10000。它通過高性能服務(wù)器集群的并行算法，對獲取的生物信息進行分配、分析、存儲、解釋，以滿足基因比對排列運算、基因語言與調(diào)控、功能基因組學(xué)等自行開發(fā)的應(yīng)用需要。
浪潮服務(wù)器的負責(zé)人介紹，浪潮天梭TS10000在醫(yī)學(xué)信息檢測技術(shù)重點實驗室的部署，兼有計算密集型和通訊密集型的特點。浪潮提供的基于Intel四核處理節(jié)點平臺的天梭TS10000集群系統(tǒng)，采用5+1的計算/管理配備方案，處理核心總數(shù)達到了40個，通過千兆以太網(wǎng)絡(luò)進行各節(jié)點間的并行通訊和高速交換運算，充分滿足客戶對高性能計算系統(tǒng)的需要。在具體實施中，天梭TS10000高性能集群系統(tǒng)性能卓越、穩(wěn)定的運行各類軟件，并行效率與加速比分別高達80%和1.7，對實驗室工作效率的提升大大超出了用戶的預(yù)期。
“浪潮天梭TS10000高性能服務(wù)器的部署，有效地解決了原有IT資源不能充分滿足實驗室對高性能計算要求的矛盾；同時有利于用戶后期的系統(tǒng)擴展升級，保護用戶投資?！?nbsp;
該負責(zé)人對科研環(huán)境的改變非常滿意：“這就是信息化建設(shè)的力量，08年我們的科研任務(wù)非常繁重，但是從現(xiàn)在的效率看，我們有信心圓滿完成?！?nbsp;
作為中國服務(wù)器第一品牌，浪潮一直密切關(guān)注我國生物科學(xué)研究，研發(fā)可無縫貼合客戶應(yīng)用的高性能服務(wù)器。早在2003年，浪潮就為華中科技大學(xué)構(gòu)建了大型生物信息數(shù)據(jù)中心，這是亞太地區(qū)第一套基于Infiniband技術(shù)的科學(xué)計算平臺；06年底，中國四核第一單——19個節(jié)點的浪潮天梭成為中科大生命科學(xué)院的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析平臺。此次南方醫(yī)科大學(xué)基于四核平臺的天梭系統(tǒng)建成，不僅顯露出浪潮在高性能計算領(lǐng)域雄厚的技術(shù)研發(fā)實力，也進一步鞏固了浪潮研發(fā)適合生物信息科研領(lǐng)域的高性能服務(wù)器的優(yōu)勢地位。
