“07年第四季度,我們實驗室的整體工作效率提高了30%以上,物信息科研任務已取得階段性成果,感謝所有同事的辛勤工作,也感謝校方給予我們的鼎力支持。”在南方醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院腫瘤研究所下屬的醫(yī)學信息檢測技術重點實驗室年底工作總結會議上,實驗室負責人慷慨陳詞,說出了每個科研人員的心聲。 

  南方醫(yī)科大學醫(yī)學信息檢測技術重點實驗室長期致力于生物信息技術的分析和科研工作,承擔過多項國家、學校的學術研究,曾經成功發(fā)現SARS病毒致命的主要物質成分,為治療SARS藥物的問世提供了可能。 

  在承擔大量的信息數據處理工作的過程中,院系師生發(fā)現,整個IT系統(tǒng)的運算性能、網絡速度、流量等壓力陡增,工作效率明顯降低。現代生物科學研究對大規(guī)??茖W計算有很深的依賴性,平臺性能對于科研進度及質量影響很大。而醫(yī)學信息檢測技術重點實驗室正在使用的服務器是多年前部署的老機型,已經不能適應現代生物信息研究對龐雜數據處理能力的需要,尤其是運算性能、網絡速度的降低,已經成為實驗室提高科研能力的巨大瓶頸。 

  醫(yī)學信息檢測技術重點實驗室向來被視為南方醫(yī)科大學乃至整個華南地區(qū)重要的生物科學研究資源,在其發(fā)展過程中得到學校領導的高度關注。在了解到這一情況后,學校馬上成立專門部門,研究實驗室IT基礎設施優(yōu)化的解決方案。經過近2個月的嚴密考察與周詳論證,南方醫(yī)科大學最終決定采購浪潮天梭TS10000高性能服務器,解決該實驗室IT系統(tǒng)優(yōu)化問題。 

  這是廣東省首次采用四核計算處理平臺構建的TS10000高性能科學計算系統(tǒng)并得到成功應用。 

  此后,浪潮與南方醫(yī)科大信息檢測技術重點實驗室通力配合,準確分析并把握了實驗室網絡應用現狀和需求特點,專門設計了高性能、低成本的服務器平臺浪潮天梭TS10000。它通過高性能服務器集群的并行算法,對獲取的生物信息進行分配、分析、存儲、解釋,以滿足基因比對排列運算、基因語言與調控、功能基因組學等自行開發(fā)的應用需要。 

  浪潮服務器的負責人介紹,浪潮天梭TS10000在醫(yī)學信息檢測技術重點實驗室的部署,兼有計算密集型和通訊密集型的特點。浪潮提供的基于Intel四核處理節(jié)點平臺的天梭TS10000集群系統(tǒng),采用5+1的計算/管理配備方案,處理核心總數達到了40個,通過千兆以太網絡進行各節(jié)點間的并行通訊和高速交換運算,充分滿足客戶對高性能計算系統(tǒng)的需要。在具體實施中,天梭TS10000高性能集群系統(tǒng)性能卓越、穩(wěn)定的運行各類軟件,并行效率與加速比分別高達80%和1.7,對實驗室工作效率的提升大大超出了用戶的預期。

 

       “浪潮天梭TS10000高性能服務器的部署,有效地解決了原有IT資源不能充分滿足實驗室對高性能計算要求的矛盾;同時有利于用戶后期的系統(tǒng)擴展升級,保護用戶投資?!?nbsp;

  該負責人對科研環(huán)境的改變非常滿意:“這就是信息化建設的力量,08年我們的科研任務非常繁重,但是從現在的效率看,我們有信心圓滿完成。” 

  作為中國服務器第一品牌,浪潮一直密切關注我國生物科學研究,研發(fā)可無縫貼合客戶應用的高性能服務器。早在2003年,浪潮就為華中科技大學構建了大型生物信息數據中心,這是亞太地區(qū)第一套基于Infiniband技術的科學計算平臺;06年底,中國四核第一單——19個節(jié)點的浪潮天梭成為中科大生命科學院的蛋白質結構解析平臺。此次南方醫(yī)科大學基于四核平臺的天梭系統(tǒng)建成,不僅顯露出浪潮在高性能計算領域雄厚的技術研發(fā)實力,也進一步鞏固了浪潮研發(fā)適合生物信息科研領域的高性能服務器的優(yōu)勢地位。 

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