IBM和喬治亞理工學(xué)院日前宣布，世界上最強(qiáng)大的超級(jí)計(jì)算集群之一將落戶(hù)喬治亞理工學(xué)院新建成的系統(tǒng)生物學(xué)研究中心。

　　該中心將使用IBM技術(shù)來(lái)推動(dòng)新藥物的研究，治療當(dāng)今一些對(duì)人類(lèi)生命威脅最大的疾病，包括癌癥。中心的研究工作將由世界領(lǐng)先的系統(tǒng)生物學(xué)家之一Jeffrey Skolnick博士領(lǐng)導(dǎo)，他曾在計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)領(lǐng)域獲得喬治亞研究聯(lián)盟杰出學(xué)者獎(jiǎng)。

　　由美國(guó)喬治亞州、喬治亞研究聯(lián)盟和美國(guó)國(guó)家健康協(xié)會(huì)出資850萬(wàn)美元成立的這一新系統(tǒng)生物學(xué)研究中心，將Skolnick博士的生物醫(yī)學(xué)研究的專(zhuān)業(yè)知識(shí)與IBM的高性能計(jì)算功能融合在一起，開(kāi)發(fā)出一臺(tái)全新的超級(jí)計(jì)算機(jī)。這個(gè)運(yùn)行Linux的全新超級(jí)計(jì)算集群將是全球運(yùn)行速度最快的超級(jí)計(jì)算集群之一，也是美國(guó)東南部研究型大學(xué)最強(qiáng)大的計(jì)算集群之一。該集群將由BellSouth公司設(shè)在亞特蘭大市中心的世界級(jí)設(shè)施來(lái)托管運(yùn)行。

　　Skolnick博士表示：“通過(guò)在研究工作中使用IBM技術(shù)，我們可以顯著縮短新藥物進(jìn)入市場(chǎng)的時(shí)間。系統(tǒng)生物學(xué)將數(shù)學(xué)、物理、化學(xué)和生物學(xué)與先進(jìn)的高性能計(jì)算和工程設(shè)計(jì)融合在一起。生物信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)使我們能夠充分利用人體基因序列提供的大量信息，使得藥物開(kāi)發(fā)人員能夠?qū)⑺麄儽仨氝M(jìn)行篩選的化合物數(shù)量減少十倍?！?/p>

　　由1000個(gè)節(jié)點(diǎn)組成的Cluster 1350系統(tǒng)基于IBM BladeCenter刀片系統(tǒng)，采用雙內(nèi)核AMD Opteron處理器，每秒鐘可完成超過(guò)8.5萬(wàn)億次計(jì)算。如果按照2005年11月的TOP500排名，這樣的性能在世界最強(qiáng)大的超級(jí)計(jì)算機(jī)中可以排到第41位。系統(tǒng)性能和可擴(kuò)展性將使學(xué)校的學(xué)生和教員能夠快速準(zhǔn)確的分析復(fù)雜的DNA和蛋白質(zhì)，以確定有關(guān)人體癌癥基因和蛋白質(zhì)的生物學(xué)和化學(xué)過(guò)程，從而為治療這類(lèi)疾病研發(fā)出更具針對(duì)性的藥物。

　　IBM BladeCenter刀片服務(wù)器副總裁Doug Balog表示：“現(xiàn)今的大學(xué)正在尋求最快、最具創(chuàng)新性和性?xún)r(jià)比最高的系統(tǒng)來(lái)幫助自己的知識(shí)群體，使其能夠?qū)⒕哂锌尚行缘难芯砍晒D(zhuǎn)化到商業(yè)市場(chǎng)。使用基于AMD Opteron LS20 IBM BladeCenter刀片服務(wù)器的Cluster 1350系統(tǒng)，喬治亞理工學(xué)院的學(xué)生和教師可以獲得足夠的處理能力和系統(tǒng)資源來(lái)幫助他們?cè)谘芯恐凶龀龈鼫?zhǔn)確的決策，并提升學(xué)院在全國(guó)最出色研究機(jī)構(gòu)中的形象。”

　　喬治亞研究聯(lián)盟主席兼首席執(zhí)行官M(fèi)ike Cassidy表示：“只有最了解技術(shù)的大學(xué)才能夠參與藥物發(fā)現(xiàn)和生物信息學(xué)領(lǐng)域的競(jìng)爭(zhēng)。喬治亞理工學(xué)院對(duì)頂級(jí)技術(shù)和研究設(shè)施的重視以及Jeff Skolnick博士和其它世界級(jí)學(xué)者們的魅力，將會(huì)提升學(xué)院在競(jìng)爭(zhēng)性市場(chǎng)中的表現(xiàn)，并吸引美國(guó)最聰明的學(xué)生加入到我們的研究團(tuán)隊(duì)中，共同推動(dòng)藥物開(kāi)發(fā)，從而改善人們的生活?！?/p>

　　通過(guò)與喬治亞理工學(xué)院和IBM的緊密合作，BellSouth為支持這一高能耗密度的超級(jí)計(jì)算集群設(shè)計(jì)了獨(dú)一無(wú)二的可靠的主機(jī)托管環(huán)境。

　　BellSouth公司首席技術(shù)官Bill Smith表示：“基于我們?cè)谥鳈C(jī)托管領(lǐng)域的背景，我們擁有足夠的靈活性和經(jīng)驗(yàn)快速創(chuàng)建一個(gè)支持喬治亞理工大學(xué)和IBM的解決方案，從而為Skolnick博士創(chuàng)造性的研究工作提供支持?！?/p>

　　新超級(jí)計(jì)算機(jī)的峰值性能超過(guò)每秒鐘16萬(wàn)億次浮點(diǎn)運(yùn)算(16 TeraFlops)，由一個(gè)包括1000個(gè)采用AMD Opteron處理器的LS20刀片服務(wù)器節(jié)點(diǎn)的集群組成?；A(chǔ)架構(gòu)節(jié)點(diǎn)運(yùn)行Red Hat Linux 4操作系統(tǒng)，計(jì)算節(jié)點(diǎn)上運(yùn)行Scientific Linux操作系統(tǒng)。這樣的超級(jí)計(jì)算機(jī)結(jié)構(gòu)組成了可以預(yù)先安裝和測(cè)試、擁有超高密度并易于管理的超級(jí)集群IBM Cluster 1350。

　　AMD全球商業(yè)業(yè)務(wù)部副總裁Kevin Knox表示：“AMD64技術(shù)提供了對(duì)運(yùn)行有最高要求的超級(jí)計(jì)算機(jī)所需的處理能力，而且不會(huì)犧牲每瓦特電力的性能效率。通過(guò)與IBM在基于AMD Opteron處理器的BladeCenter刀片服務(wù)器集群上的緊密合作，我們相信喬治亞理工學(xué)院的研究人員將獲得更好的設(shè)備，在苛刻的時(shí)間限制下完成工作，以更快的速度為市場(chǎng)提供重要的藥物和研究成果。”